En humanos, el par cromosómico 4 y el par cromosómico 5, son del mismo tamaño, con el centrómero en la misma posición en ambos pares, sin embargo, no son homólogos entre sí, explica por qué

Porque portan genes que codifican para características diferentes. Tienen información.

Explanation:

Las células somáticas diploides cuentan con un juego de cromosomas  heredado del padre y otro juego heredado de la madre. Cada cromosoma en uno de los juegos tiene su par homólogo y comparable en el otro juego.

Las posiciones de las formas alélicas de uno de los cromosomas de un juego se corresponden con las forma alélicas del cromosoma del otro juego, que es su homólogo. Es decir, que cromosomas homólogos portan información sobre las mismas características, y los genes que portan esa información están ubicados en la misma posición en ambos cromosomas.  

A pesar que los cromosomas 4 y 5 sean morfológicamente muy similares, portan información que codifica para distintas características, lo que los distingue como no homólogos, y representan distintos porcentajes del ADN total. Las posiciones de las formas alélicas de uno de los cromosomas de un juego NO se corresponden con las forma alélicas del cromosoma del otro juego, que es su homólogo.